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Génomique des canards

Résumé





La démocratisation des outils de la génomique et plus particulièrement du séquençage à haut débit a permis le séquençage du génome du canard commun. Des projets complémentaires sont déjà initiés pour prolonger et exploiter au mieux ces premiers acquis. En tout premier lieu, il s’agit de poursuivre la description de la structure du génome et d’en exploiter les connaissances : cartes d’hybrides irradiés pour ordonner la séquence le long des chromosomes ; génomique comparée avec le génome de la poule pour bénéficier des connaissances sur ce génome modèle ; recherche de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour les études et la gestion de populations ; carte génétique pour la détection des QTL (Quantitative Trait Locus). La première détection de QTL influençant les performances du mulard, réalisée à l’aide de marqueurs microsatellites chez la cane commune, sera complétée par une seconde étude utilisant des marqueurs SNP développés spécifiquement et permettant une bien meilleure couverture du génome. Par ailleurs, il est important de réaliser une annotation fonctionnelle du génome, ce qui peut être abordé par le séquençage de transcrits. A terme, le génome annoté sera utilisé pour analyser son expression dans différents tissus et/ou conditions d’élevage, la connaissance des modèles de transcrits et de protéines facilitant les études en transcriptomique et protéomique. Le canard mulard,  produit du croisement de la cane commune avec le canard de Barbarie, devra également être étudié en raison de son intérêt agronomique, lié à ses performances exceptionnelles dans la filière des palmipèdes gras.





Auteurs


A. VIGNAL

alain.vignal@toulouse.fr

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


C. DIOT

Affiliation : INRA, UMR1348 PEGASE, F-35590 Saint-Gilles, France

Pays : France


C. MOLETTE

Affiliation : INRA, UMR1289 TANDEM, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


M. MORISSON

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


T. FARAUT

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


M. RAO

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


F. PITEL

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


V. FILLON

Affiliation : INRA, UMR444 Génétique Cellulaire, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France


C. MARIE-ETANCELIN

Affiliation : INRA, URO631 SAGA, F-31326 Castanet-Tolosan, France

Pays : France

Pièces jointes

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